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fsl-5.0-core - クラウドでオンライン

Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーター上の OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで fsl-5.0-core を実行します。

これは fsl-5.0-core コマンドで、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できます。

プログラム:

NAME


fsl-FMRI、MRI、DTI脳イメージング用の分析ツール

DESCRIPTION


FSL は、医用脳画像データを分析するための包括的なツールキットです。 それ
データ前処理、脳抽出、画像レジストレーション、および
幅広い統計分析。 FSL 使いやすいGUIを提供します。

FSL いくつかの環境変数を適切に設定する必要があります。 これを達成するために、
/etc/fsl/5.0/fsl.shから構成スクリプトを入手してください。 これを行うXNUMXつの方法
自動的にを含む行を追加することです

。 /etc/fsl/5.0/fsl.sh

ユーザーのホームディレクトリの.bashrcファイル(または他のシェルの対応するファイル)
bashより)。 最初にそのようなファイルを作成する必要があるかもしれません。

または、Debianパッケージは、のすべてのFSLツールのシンボリックリンクをインストールします。 / usr / bin それ
適切な構成を自動的にロードするように注意してください。 シンボリックリンク名は
対応する接頭辞 FSL ファイル名の競合を防ぎ、許可するバージョン
同じシステム上に共存する複数のバージョン。 たとえば、 スライサー コマンドは
として利用可能 fsl5.0-スライサー。 ご使用の際はご注意ください FSL これらのシンボリックリンクを介したツールは
上記のセットアップ手順を実行するために必要です。 しかし、この便利さ
機能はDebian固有です。 FSLコマンドを使用し、共有することを目的としたスクリプト
他の人と一緒に、接頭辞のないコマンド名とFSL環境変数に依存する必要があります
セットアップ。

  FSL ユーザーインターフェイスは時々参照します FSLDIR。 Debianシステムでは、これは
/usr/share/fsl/5.0 FSLバージョン5.0の場合。

FSL ドキュメントとオンラインヘルプは、 fsl-5.0-doc パッケージ。

の使用法に関する質問 FSL または関連する理論はに投稿することができます FSL 郵送
リスト (参照してください http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).

並列化


FSLは、実行中のSun Gridengine(SGE)にジョブを送信するように構成できます。 すべてではありませんが
FSLに実装された機能は、この種の並列化をサポートします。これは最も要求の厳しいものです。
処理ツール(POSSUMやFDTなど)はそうします。

FSLは、SGE_ROOT環境変数が設定されていない場合でも、次のようにSGEを使用できる必要があります。
SGEのDebianパッケージの場合。 バッチ処理を有効にするには、

FSLPARALLEL = 1

FSLが実行されているシェル内。 これはで恒久的に有効にすることができます

/etc/fsl/5.0/fsl.sh

またはケースバイケースで。

onworks.net サービスを使用してオンラインで fsl-5.0-core を使用する


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