gdcm2vtk-クラウドでのオンライン

プログラム：

NAME

gdcm2vtk-VTKでサポートされているファイルをDICOMに変換します。

SYNOPSIS

gdcm2vtk [オプション]ファイルインファイルアウト

DESCRIPTION

　 gdcm2vtk VTKでサポートされているすべてのファイル（DICOMファイルを含む）を入力として受け取り、
DICOMファイルを出力として生成します。

パラメーター

ファイル入力入力ファイル名（DICOMまたはVTKをサポート）

file-out出力ファイル名（DICOMまたはVTKをサポート）

OPTIONS

特定の オプション
--force-rescale力の再スケール。
--force-spacing力の間隔。
--palette-colorサポートされている場合、PALETTECOLORファイルを生成します。
--argbがサポートされている場合、ARGBファイルを生成します。
--compressサポートされている場合、圧縮ファイルを生成します。
--use-vtkdicom（GDCMの代わりに）vtkDICOMImageReaderを使用します。
-モダリティセットモダリティ。
--lower-leftは左下に設定します。
-シフトセットシフト。
-スケールセットスケール。
--compress setcompression（MetaIO）。
-T--study-uidスタディUID。
-S--series-uidシリーズUID。
--root-uidルートUID。

オプション
-J --jpegjpegで画像を圧縮します。
-K --j2kj2kで画像を圧縮します。
-L --jpeglsjpeg-lsで画像を圧縮します。
-R --rle rleで画像を圧縮します（ロスレスのみ）。

一般的な オプション
-h --ヘルプ
このヘルプテキストを印刷して終了します

-v --バージョン
バージョン情報を印刷して終了します

-V --冗長
詳細モード（警告+エラー）。

-W--警告
警告モード、警告情報を出力

-E--エラー
エラーモード、エラー情報の印刷

-D --デバッグ
デバッグモード、デバッグ情報の出力

環境 変数
GDCM_ROOT_UIDルートUID

DESCRIPTION

VTKでサポートされているファイルをDICOMに変換します。

一般的な使用法は次のとおりです。

$ gdcm2vtk 入力ファイル output.dcm

VTKの内部ファクトリメカニズムを使用してファイルを認識します（CanRead関数）。 見る
ここでVTKがサポートするファイル：

VTKはどのような画像ファイル形式を読み書きできますか？ http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ＃What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

入力ファイルに4つのコンポーネントがある場合、4番目のコンプ（アルファ）は出力から削除されます
DICOMはアルファコンポーネントをサポートしなくなったため、ファイル（–argbオプションを参照）。

次のファイル形式には特別な注意が払われました。

1. DICOM：方向余弦とvtkMedicalImageInformationが出力に渡されます
2. BMP：ファイルはルックアップテーブルで保存できます（--palette-colorを参照）
3. GE Signa：vtkMedicalImagePropertiesが出力に渡されます
4. MINC：方向余弦が出力に渡されます
5. TIFF：vtkTIFFReaderは現在VTKで悪い状態になっています（VTK5.2とgit / masterで異なる動作）。 自分が何をしているのかを知っている場合にのみ使用してください。

CONVERT メタイメージ （mhd、 mha）
$ gdcm2vtk 入力ファイル output.mha

このコマンドは、入力DICOMファイル：inputfileをMetaImage.mhaファイルに変換します。 同じ
.mhdファイルに移動します。

CONVERT MHA / MHD
$ gdcm2vtk 入力ファイル output.mha

or

$ gdcm2vtk 入力ファイル output.mhd

このコマンドは、入力DICOMファイルを変換します：inputfileをMetaImageData .mha / .mhdに変換します
ファイルにソフトウェアを指定する必要があります。

CONVERT VTI
$ gdcm2vtk 入力ファイル output.vti

このコマンドは、入力DICOMファイルを変換します：inputfileをXML VTK ImageData .vti
ファイルにソフトウェアを指定する必要があります。

CONVERT VTK
$ gdcm2vtk 入力ファイル output.vtk

このコマンドは、入力DICOMファイルを変換します：inputfileを古いVTK構造化に変換します
PointSets.vtkファイル。

CONVERT DICOM

$ gdcm2vtk 入力.dcm 出力.dcm

vtkGDCMImageReader デフォルトではなく、DICOMファイルの読み取りに使用されます
vtkDICOMImageReader。 vtkDICOMImageReaderを使用するには、オプション–use-vtkdicomを参照してください。

往復 DICOM に MHD に DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm Output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 出力.mhd 出力.dcm

上記の参照は、の測光解釈を使用してDICOMを変換する方法を示しています
YBR_FULL（またはYBR_FULL_422は不可逆）を別のファイル形式に変換します：MetaImage（mhd）。 以来
このファイル形式は色空間を処理しないため、を使用して明示的に設定する必要があります。
–imageformatコマンドラインオプション。 これには、–modalityコマンドラインオプションが必要です。
デフォルトのセカンダリキャプチャイメージストレージクラスファミリではYBRが許可されていないため、
測光解釈。

GDCM2VTK 注意事項

重要な注意：構造化された内部VTKは、入力DICOMから入力され、その後
出力DICOMライターに渡します。 変換中に一部の情報が失われる可能性があります
DICOMからVTK、DICOMへ。 このオプションは主にテストに使用されます
vtkGDCMImageReader / vtkGDCMImageWriterの組み合わせ。

重要な注意：JPEGなどの不可逆形式から変換する場合、
喪失感は重要です。 出力DICOMには、必要な不可逆画像が含まれます
画像が不可逆圧縮されたことを示す圧縮属性
パイプライン。 gdcmimg（一般的なJPEGのより良い処理）も参照してください。

重要な注意：–use-vtkdicomを使用する場合、出力DICOMファイルは常に次のように書き込まれます。
この情報はリーダー自体からは入手できないため、MRイメージストレージ。 これにより
画像の向き（患者）を正しく設定します。

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