これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gmod_make_cvtermpath.plp です。
プログラム：
NAME
gmod_make_cvtermpath.pl - オントロジー用語の推移閉包を計算します
cvterm テーブル
USAGE
perl gmod_make_cvtermpath.pl -H [dbhost] -D [dbname] [-vt] -c cvname
perl gmod_make_cvtermpath.pl -g [GMODConf_profile] -c cvname
技術パラメータ
-c 推移閉包を計算するオントロジーの名前 (cv.name)。 （必須）
-v 詳細出力
-t 試用モード。 ストア操作は一切行わないでください。 (未実装)
-o エラーと詳細メッセージを書き込むための outfile (オプション)
-g GMOD データベース プロファイル名 (ホストと DB 名を指定可能) デフォルト: 'default'
If a GMOD データベース プロフィール （オプション -g) その後 フォーム しなければなりません 提供します フォロー中
パラメータ
-D データベース名
-H ホスト名
-d データベース ドライバ名 (postgres の場合は「Pg」など)
-u [オプション - デフォルトのユーザーを使用しない場合] データベースのユーザー名
-p [オプション - データベースへの接続にパスワードが必要な場合] ユーザーのパスワード
データベースに接続するには
DESCRIPTION
このスクリプトは、cvterm テーブルのオントロジー用語の推移閉包を計算します。
これは計算集約的な操作であるため、Gene のような大きな cv で行う
オントロジーには数時間かかることがあります。 トランザティブ クロージャの詳細については、
見てください：
http://www.geneontology.org/GO.database.shtml#グラフ
onworks.net サービスを使用してオンラインで gmod_make_cvtermpath.plp を使用する
