これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gmx-sigeps です。
プログラム:
NAME
gmx-sigeps - c6/12 または c6/cn の組み合わせと sigma/epsilon との変換
SYNOPSIS
gmx シゲプス [-o [<.xvg>]] [-[今] [-xvg ] [-c6 ]
[-cn ] [-捕虜 ] [-シグ ] [-eps ]
[-A ] [-B ] [-C ] [-気 ]
[-qj ] [-シグファク ]
DESCRIPTION
GMX シゲプス C6/C12 または C6/Cn の組み合わせをシグマに変換し、
イプシロン、またはその逆。 ファイル内のポテンシャルをプロットすることもできます。 さらに、
バッキンガム ポテンシャルをレナード ジョーンズ ポテンシャルに近似します。
OPTIONS
出力ファイルを指定するオプション:
-o [<.xvg>] (potje.xvg)
xvgr / xmgrファイル
その他のオプション:
-[今 (いいえ)
出力を表示 .xvg, .xpm, .eps & .pdb ファイル
-xvg
xvgプロットのフォーマット:xmgrace、xmgr、なし
-c6 (0.001)
C6
-cn (1e-06)
反発力の定数
-捕虜 (12)
反発項の力
-シグ (0.3)
シグマ
-eps (1)
イプシロン
-A (100000)
バッキンガムA
-B (32)
バッキンガムB
-C (0.001)
バッキンガムC
-気 (0)
qi
-qj (0)
qj
-シグファク (0.7)
プロットを開始するためのシグマの前の因数
onworks.net サービスを使用してオンラインで gmx-sigeps を使用する