これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gt-eval です。
プログラム：
NAME
gt-eval - 注釈ファイルを比較し、精度測定 (予測と参照) を表示します。
SYNOPSIS
gt 評価する reference_file 予測ファイル
DESCRIPTION
-nuc [はい|いいえ]
ヌクレオチドレベルを評価します (メモリ消費量は入力ファイルサイズに比例します)
（デフォルト：はい）
-ltr [はい|いいえ]
遺伝子予測の代わりに LTR レトロトランスポゾン予測を評価する (すべて
LTR_retrotransposon 要素は、未決定のストランドを持つと見なされます) (デフォルト:
いいえ）
-ltrdelta [値]
LTR 境界が等しいと見なされる許容デルタを設定します (デフォルト: 20)
-v [はい|いいえ]
冗長にする（デフォルト：いいえ）
-o [ファイル名]
指定されたファイルに出力をリダイレクトします（デフォルト：未定義）
-gzip [はい|いいえ]
gzip圧縮出力ファイルの書き込み（デフォルト：no）
-bzip2 [はい|いいえ]
bzip2圧縮出力ファイルの書き込み（デフォルト：no）
-力 [はい|いいえ]
出力ファイルへの書き込みを強制します（デフォルト：no）
-助けて
ヘルプを表示して終了します
-バージョン
バージョン情報を表示して終了します
このプログラムは、特定の機能タイプの感度と特異度の値を表示します (例:
遺伝子、mRNA、およびエクソン)。 一部の機能タイプでは、欠落している機能と間違っている機能の数
そのタイプも表示されます。 これにより、「欠落」とは、そのタイプの機能の数を意味します
「予測」からのそのタイプの特徴と重複しない「参照」。 バイス
逆に、「間違った」は、「予測」からのそのタイプの特徴の数を示します。
「参照」からそのタイプの機能にオーバーラップします。
報告 バグ
バグを報告する[メール保護]>.
onworks.net サービスを使用してオンラインで gt-eval を使用する
