これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドmaq.plです。
プログラム：
NAME
maq.pl-maqのヘルパースクリプト
SYNOPSIS
maq.pl [オプション] [...]
DESCRIPTION
maqのヘルパースクリプト
バージョン：0.4.7
オプション。
イージーラン
小さなデータセット用のシンプルなパイプライン
デモ maq機能のデモンストレーション（SEのみ）
SNPフィルター
SNPをフィルタリングする
統計マップ
'maqmap'のエラー出力から統計を抽出します
chrpt2snp
dbSNPのchr_rptファイルを.snpファイルに変換します
ucsc2snp
UCSCのSNPダンプを.snpファイルに変換します
速いq2bfq
fastqをバッチで変換する
猫2ペア
ペアエンドリード形式の変換
sv 構造変異を呼び出す
インデルペ
インデルペ出力の後処理
onworks.netサービスを使用してオンラインでmaq.plを使用する
