これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレータ、MAC OS オンライン エミュレータなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダで実行できるコマンド mia-XNUMXdmyocard-icaseries です。
プログラム：
NAME
mia-2dmyocard-icaseries - 一連の 2D 画像に対して ICA 解析を実行します。
SYNOPSIS
mia-2dmyocard-icaseries -i [オプション]
DESCRIPTION
mia-2dmyocard-icaseries このプログラムは、一連の心筋に対して ICA を実行するために使用されます。
合成参照を作成するためにセグメンテーション セットで指定された灌流画像。
画像レジストレーションによる動き補正に使用できます。 フル稼働が目的の場合は、
動き補償を行う場合は、mia-2dmyoica-nonrigid を実行することをお勧めします。このプログラムは
登録ビットがなければ基本的に同じです。
OPTIONS
ファイル-IO
-i --in-file=(入力、必須); 弦
入力灌流データセット
-r --references=(出力); 弦
参照画像のファイル名ベース。 画像の種類と番号付けスキームは次のとおりです。
入力画像から取得されます。
-c --save-cropped=(出力); 弦
元のセットのトリミングされたセットをこのファイルに保存すると、画像ファイルは使用します
ファイル名ベースとしての名前の語幹
--save-feature=(出力); ストリング
ICAから得られた特徴画像といくつかの中間画像を保存します
PNG ファイルに基づいて指定されたファイル名を持つ RV-LV セグメンテーションに使用されます。
また、初期ベストと最終 IC ミキシングの係数を保存します。
マトリックス。
カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する
-著作権
著作権情報を印刷する
-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する
-? - 使用法
短いヘルプを印刷する
- バージョン
バージョン番号を出力して終了します
ICA
-C --コンポーネント=0
ICA コンポーネント 0 = 自動推定ICA コンポーネント 0 = 自動
推定
- ノーマライズ
正規化されたIC
--ノー・ミーンストリップ
混合曲線から平均値を取り除かないでください
-s --segscale=1.4
LV (0=セグメンテーションなし) セグメントの周囲でクロップ ボックスをセグメント化し、スケーリングします。
LV を中心にクロップ ボックスをスケーリングします (0 = セグメンテーションなし)。
-k --スキップ=0
シリーズの最初の画像は他の画像と同様にスキップします
モダリティ他のものと同様に、シリーズの最初の画像をスキップします
モダリティ
-m --max-ica-iter=400
ICA の最大反復数ICA の最大反復数
-E --segmethod=機能
セグメンテーション方法
デルタピーク ‐ ピーク強調画像の違い
機能を使用 ‐ 特集画像
デルタ機能 ‐ 特徴画像の違い
処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。
実施例
setsegment.set から合成参照を評価し、refXXXX.??? に保存します。 に
2 つの独立したコンポーネントを使用し、XNUMX つの画像をスキップします。 デフォルトでは境界ボックス
LV 周囲がセグメント化されて 1.4 倍に拡大縮小され、切り取られた画像が次の場所に保存されます。
作物XXXX.??? そしてセグメンテーション セット Cropped.set が作成されます。 画像ファイルの種類は？ は
セグメント.set の入力画像から差し引かれます。
mia-2dmyocard-icaseries -i セグメント.セット -r ref -o ref -k 2 -C 5
著者
ガート・ウォルニー
COPYRIGHT
このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
絶対的な保証はなく、GNU の規約に基づいて再配布できます。
GENERAL PUBLIC LICENSE バージョン 3 (またはそれ以降)。 詳細については、次のコマンドを使用してプログラムを実行してください。
オプション「--copyright」。
onworks.net サービスを使用してオンラインで mia-2dmyocard-icaseries を使用する
