mia-3dgetslice - クラウドでオンライン

プログラム：

NAME

mia-3dgetslice - 3D 画像からスライスを抽出します。

SYNOPSIS

mia-3dgetslice -i -o [オプション]

DESCRIPTION

mia-3dgetslice このプログラムは、2D データセットから 3D スライスを抽出して保存するために使用されます。
別のファイルにあります。 出力ファイルには、スライス インデックスに従って番号が付けられます。

OPTIONS

-i --in-file=(入力、必須); イオ
フィルタリングされる入力画像 サポートされているファイル タイプについては、を参照してください。
プラグイン:3dimage/io

-o --out-file=(出力、必須); イオ
出力画像。 数値 != 1 の場合、これはベース名として使用されるため、
これは「--type」オプションに基づくため、拡張子なしで指定できます。
数値=1 の場合、この正確なファイル名が使用されます。 サポートされているファイルの場合
タイプについては、PLUGINS:2dimage/io を参照してください。

-t --type=png
番号 != 1 の出力ファイルのタイプ
サポート 値 は：（ bmp、 データプール、 ディコム、 例、 jpg、 png、 生、
tif、 意見、 )

-s --start=0
開始スライス番号開始スライス番号

-n --number=1
スライスの数 (すべて = 0)スライスの数 (すべて = 0)

--n桁=4
ファイル名数値の最小桁数(n != 1の場合)最小数値
ファイル名番号の桁数 (n != 1 の場合)

-d --dir=xy
スライス方向 (xy=軸方向、xz=冠状方向、yz=矢状方向)
xz ‐ xz (冠状) スライスを取得します
yz ‐ yz (矢状) スライスを取得します
xy ‐ xy (アキシャル) スライスを取得します

カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する

-著作権
著作権情報を印刷する

-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する

-? - 使用法
短いヘルプを印刷する

- バージョン
バージョン番号を出力して終了します

処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。

プラグイン: 2D画像/IO

bmpファイル BMP 2D 画像入出力サポート

認識されるファイル拡張子: .BMP、.bmp

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット

データプール 内部データプールとの間の仮想IO

認識されるファイル拡張子: .@

ディコム DICOM用の2D画像io

認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm

サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット

元 OpenEXR 画像用の 2dimage io プラグイン

認識されるファイル拡張子: .EXR、.exr

サポートされている要素タイプ:
符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット

JPG JPEGグレースケール画像用の2dimage ioプラグイン

認識されるファイル拡張子: .JPEG、.JPG、.jpeg、.jpg

サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット

PNG PNG画像用の2dimage ioプラグイン

認識されるファイル拡張子: .PNG、.png

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット

生 RAW 2D画像出力対応

認識されるファイル拡張子: .RAW、.raw

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

TIF TIFF 2D画像入出力サポート

認識されるファイル拡張子: .TIF、.TIFF、.tif、.tiff

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット、符号なし32ビット

ビスタ Vista 画像用の 2dimage io プラグイン

認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

プラグイン: 3D画像/IO

分析します 7.5画像を分析する

認識されるファイル拡張子: .HDR、.hdr

サポートされている要素タイプ:
符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号付き 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、
浮動小数点64ビット

データプール 内部データプールとの間の仮想IO

認識されるファイル拡張子: .@

ディコム 3D としての Dicom 画像シリーズ

認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm

サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット

HDF5 HDF5 3D画像IO

認識されるファイル拡張子: .H5、.h5

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点
小数点32ビット、浮動小数点64ビット

インリア インリア画像

認識されるファイル拡張子: .INR、.inr

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

MHD MetaIO VTK 実装を使用した 3D 画像 IO (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .MHA、.MHD、.mha、.mhd

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

気の利いた NIFTI-1 3D画像IO

認識されるファイル拡張子: .NII、.nii

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点 32
ビット、浮動小数点64ビット

VFF VFF Sun ラスター形式

認識されるファイル拡張子: .VFF、.vff

サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット、符号付き16ビット

ビスタ 3Dビュー

認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

vti 3D 画像 VTK-XML の入力および出力 (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .VTI、.vti

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

VTK 3D VTK 画像のレガシー入力および出力 (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .VTK、.VTKIMAGE、.vtk、.vtkimage

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

実施例

image.v のスライス 5coronalXXXX.png から始まる 120 つの冠状スライスを保存します。

mia-3dgetslice -i image.v -o コロナル -t png -n 5 -s 120

著者

ガート・ウォルニー

COPYRIGHT

このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
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GENERAL PUBLIC LICENSE バージョン 3 (またはそれ以降)。 詳細については、次のコマンドを使用してプログラムを実行してください。
オプション「--copyright」。

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