これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mia-3dsegment-ahmed です。
プログラム：
NAME
mia-3dsegment-ahmed - 3D 画像のファジー c-means セグメンテーションを実行します.
SYNOPSIS
mia-3dsegment-アーメド -i -c [オプション]
DESCRIPTION
mia-3dsegment-アーメド このプログラムは、次の論文のバリエーションを実装しています: Mohamed N. Ahmed et.
al、「MRI のバイアス フィールド推定とセグメンテーションのための修正ファジー C-Means アルゴリズム
Data」、IEEE Trans. on Medical Imaging、Vol. 21、No. 3、2002 年 2 月、変更点: p=XNUMX、および
EXP
OPTIONS
ファイル-IO
-i --in-file=(入力、必須); イオ
セグメント化するイメージ サポートされているファイル タイプについては、PLUGINS:3dimage/io を参照してください
-c --class-file=(出力、必須); いお
クラス確率画像、画像タイプは複数の画像をサポートする必要があり、
浮動小数点値 サポートされているファイル タイプについては、PLUGINS:3dimage/io を参照してください。
-b --out-file=(出力); いお
バイアス補正された画像は、入力画像と同じタイプになります。 これなら
パラメータが指定されていない場合、バイアス補正は適用されません。 為に
サポートされているファイル タイプは PLUGINS:3dimage/io を参照してください
カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する
-著作権
著作権情報を印刷する
-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する
-? - 使用法
短いヘルプを印刷する
- バージョン
バージョン番号を出力して終了します
計測パラメータ
-n --クラス数=3
クラス数クラス数
-C --クラスセンター=
初期のクラス センターでは、このパラメーターは「no-of-classes」をオーバーライドします。
-s --spread=64
マタールの区別の強さを表すスプレッドパラメータspread
マタールの区別の強さを表すパラメータ
処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。
プラグイン: 3D画像/IO
分析します 7.5画像を分析する
認識されるファイル拡張子: .HDR、.hdr
サポートされている要素タイプ:
符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号付き 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、
浮動小数点64ビット
データプール 内部データプールとの間の仮想IO
認識されるファイル拡張子: .@
ディコム 3D としての Dicom 画像シリーズ
認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm
サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット
HDF5 HDF5 3D画像IO
認識されるファイル拡張子: .H5、.h5
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点
小数点32ビット、浮動小数点64ビット
インリア インリア画像
認識されるファイル拡張子: .INR、.inr
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
MHD MetaIO VTK 実装を使用した 3D 画像 IO (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .MHA、.MHD、.mha、.mhd
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
気の利いた NIFTI-1 3D画像IO
認識されるファイル拡張子: .NII、.nii
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点 32
ビット、浮動小数点64ビット
VFF VFF Sun ラスター形式
認識されるファイル拡張子: .VFF、.vff
サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット、符号付き16ビット
ビスタ 3Dビュー
認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
vti 3D 画像 VTK-XML の入力および出力 (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .VTI、.vti
サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット
VTK 3D VTK 画像のレガシー入力および出力 (実験的)。
認識されるファイル拡張子: .VTK、.VTKIMAGE、.vtk、.vtkimage
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
実施例
入力画像 input.v に対して 5 クラス セグメンテーションを実行し、クラス確率画像を保存します。
cls.vで。
mia-3dsegment-ahmed -i input.v -a 5 -o cls.v
著者
ガート・ウォルニー
COPYRIGHT
このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
絶対的な保証はなく、GNU の規約に基づいて再配布できます。
GENERAL PUBLIC LICENSE バージョン 3 (またはそれ以降)。 詳細については、次のコマンドを使用してプログラムを実行してください。
オプション「--copyright」。
onworks.net サービスを使用してオンラインで mia-3dsegment-ahmed を使用する
