これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mincaverage です。
プログラム：
NAME
mincaverage - 平均 minc ファイル
SYNOPSIS
最小平均 [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc
DESCRIPTION
最小平均 minc ファイルをまとめて平均化します。 オプションの動作の範囲は次のように許可されます。
よく: ボリュームの事前正規化、標準偏差ボリュームの作成、
入力ファイルの指定されたサイズ。
OPTIONS
オプションは（一意である限り）省略形で指定できることに注意してください。
コマンドラインのどこにでも指定できます。
オプション
-2 MINC 2.0 形式の出力ファイルを作成します。
-クロバー
既存のファイルを上書きします。
-ノクロバー
既存のファイルを上書きしません (デフォルト)。
-詳細
コピーされたデータの各チャンクの進行状況情報を出力します (デフォルト)。
-静かな 進行状況情報を印刷しないでください。
-デバッグ 追加情報 (正規化係数など) を出力します。
-ファイルリスト ファイル名
入力ファイル名のリストを含むファイルを指定します。 「-」を指定した場合、ファイル
名前は標準入力から読み取られます。 このオプションが指定されている場合、入力はありません
コマンドラインで指定されたファイル名。 入力ファイルの空行は
無視されます。
-max_buffer_size_in_kb バッファサイズ
内部バッファの最大サイズをキロバイト単位で指定します。 デフォルトは4096です
キロバイト。
出力 type オプション
これらのオプションは、個々のボクセル値の格納精度とサイズを制御します。
出力ファイル。
-ファイルの種類
型変換を行いません (デフォルト)。
-バイト 8 ビット整数値を書き出します。
-ショート 16 ビット整数値を書き出します。
-int 32 ビット整数値を書き出します。
-長いです -int に置き換えられました。
-浮く 単精度浮動小数点値を書き出します。
-ダブル
倍精度浮動小数点値を書き出します。
-署名済み 値を符号付き整数として書き出します (short および long のデフォルト)。 無視されました
浮動小数点型。
-署名なし
値を符号なし整数として書き出します (バイトのデフォルト)。 フローティングの場合は無視されます
ポイントの種類。
-範囲 分 マックス
出力ボクセル値の有効な範囲を整数表現で指定します。
デフォルトは、型と符号の全範囲です。 このオプションは無視されます
浮動小数点値。 何らかの効果を得るには、タイプを指定する必要があります。
アベレージ オプション
-ノーマライズ
ボリュームを平均化する前に、ボリュームをグローバル平均に正規化します (平均に基づいて)
最小値を超える全範囲の 2% を超える値を持つボクセルの数)。
-nonormalize
ボリュームを正規化しません (デフォルト)。
-sdfile sdfile.mnc
さらに計算する出力標準偏差ファイルの名前を指定します
通常計算される平均。
-ウェイトファイル 体重ファイル.mnc
出力累積ボクセル ウェイト ファイルを指定します (デフォルト = なし)。
-コピーヘッダー
最初の入力ファイルからすべての追加ヘッダー情報をコピーします (デフォルト
XNUMX つの入力ファイルの場合)。
-nocopy_header
追加のヘッダー情報をコピーしません (多くの入力ファイルのデフォルト)。
-avgdim ディムネーム
平均化する (または計算する) 次元の名前を指定します。
標準偏差）。 正規化が行われた場合でも、個別にのみ適用されます
ファイルのみ - ファイル内で正規化は行われません。
-二値化
平均を計算する前に、入力ボリュームを XNUMX 値化します。 二値化が完了しました
平均に 1 を与える値の範囲を指定します。 の正規化
二値化を実行する場合、入力は許可されません。
-binrange 分 マックス
二値化する値の範囲を指定します。
-ビン値 値
XNUMX 値化の有効な値 (整数) を XNUMX つ指定します。 範囲は +/- に設定されています
入力値の効果的な丸めを実現するために、この値の周りに 0.5 を加えます。
-ignore_below 値
この値を下回るボクセルを平均および標準偏差に含めないでください
-ignore_above 値
この値を超えるボクセルを平均および標準偏差に含めないでください
-床 値
の同義語 -ignore_below
-ignore_above 値
の同義語 -ignore_above
-重み
平均化のための一連の重みを指定します。 重み付け値の数は
入力ファイルの数と一致し、値は単一として提供する必要があります
コンマまたはスペースをセパレータとして使用して引数を指定します。 重みの合計は非
ゼロ。 平均化ディメンションで重みを使用する場合、入力ファイルは XNUMX つだけです。
指定されること。
-width_weighted
このオプションは、ディメンション全体で平均化する場合にのみ使用できます (-avgdim オプション）。 これ
対応する幅変数を使用して重み付けを行うことを指定します
平均次元に。 たとえば、 -width_weighted -avgdim 時間
時間幅変数を使用して値を重み付けします。
-min_weight 値
これは最小の重みを指定します (重みが指定されていない場合はボリュームの数)
有効な平均を計算するために必要です。 ボクセルの累積重みが
このしきい値を下回ると、報告される平均と標準偏差は 0 になります。これは通常、
のいずれかを使用して値を除外する場合に役立ちます。 -無視 オプション、または NaN 値による
入力ボリューム内。
-min_weight_fraction 値
と同じ -min_weight、ただし、入力重みの合計の一部として指定
(または、重みが指定されていない場合は、入力ボリュームの数)。
ジェネリック オプション for を
-助けて コマンドラインオプションの概要を出力して終了します。
-バージョン
プログラムのバージョン番号を出力して終了します。
onworks.net サービスを使用してオンラインで mincaverage を使用する
