これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド miraSearchESTSNPs です。
プログラム：
NAME
miraSearchESTSNPs - さまざまな系統の EST で SNP を発見するためのパイプライン
DESCRIPTION
プログラム miraSearchESTSNPs を使用して、異なる菌株からの EST データを組み立てることができます。
(または有機体) およびこのアセンブリ内の SNP 検出。 これは以前のmiraESTプログラムです
MIRA を est モードで使用するか、
ミラエスト。
miraSearchESTSNPs は、初期の mRNA 転写配列を再構築するパイプラインです。
複数の菌株の EST シーケンシング プロジェクトで収集され、信頼できる基礎となる可能性があります。
クラスタリングやエクソン解析などのその後の解析ステップに。 つまり、遺伝子さえも
異なる対立遺伝子に転写された SNP を XNUMX つだけ含むものは、最初に異なるものとして扱われます。
写し。 アセンブリ プロセスのオプションの最後のステップは、単純な構成にすることができます。
同じエクソン配列を含む転写物を組み立てることができるクラスタラー -- ただし、
SNP の位置が異なり、XNUMX つのコンセンサス配列になります。 そのような SNP を分析することができます。
分類され、対応する mRNA トランスクリプトーム配列に確実に割り当てられます。
ただし、miraSearchESTSNPs はアセンブラであり、完全な機能ではないことに注意することが重要です。
吹き飛ばされたクラスタリングツール。
SYNOPSIS
バージョン 3.9.17 では、この機能は無効になっています。
onworks.net サービスを使用してオンラインで miraSearchESTSNP を使用する
