これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド njplot です。
プログラム：
NAME
njplot - 生物学者のための系統樹描画プログラム newicktops - 系統樹の描画
ツリーを PostScript ファイルに取り込む
SYNOPSIS
njplot [オプション] ツリーファイル
ニューウィックトップ [オプション] ツリーファイル
newicktotxt [オプション] ツリーファイル
DESCRIPTION
このマニュアルページでは、 njplot
当学校区の ニューウィックトップ このコマンドはまったく同じことを行いますが、X11 ディスプレイは必要ありません。 出力は
PostScript ファイルにレンダリングされます。
当学校区の newicktotxt コマンドは次とまったく同じことを行います ニューウィックトップ しかし、出力はレンダリングされます
テキストファイルに。
このマニュアル ページは、Debian GNU/Linux ディストリビューション用に書き直されました。
プログラムにはマニュアルページがありません。
njplot 任意のバイナリまたは多分岐ツリーを描画できるツリー描画プログラムです。
標準の系統樹形式 (たとえば、PHYLIP パッケージで使用される形式) で。
NJplot は、倹約から得た根のない木を根付かせるのに特に便利です。
距離または最尤ツリー構築方法。
ルート化されていないツリーのルート化は、マウスを使用して対話的に指定できます。 NJプロット
ズーム、ブランチの交換、ブートストラップ スコアの表示、ファイルへの保存も可能です。
ポストスクリプト形式。 したがって、NJplot は、任意のパッケージのグラフィカル拡張機能として使用できます。
ツリーを保存するために標準ツリー形式を使用する系統発生プログラム (つまり、
ほとんどのそのようなパッケージで)。
OPTIONS
x ターミナル エミュレータでのみ動作する次のオプションのみがあり、x ターミナル エミュレータでは動作しません。
コンソールモード:
-h 簡単なヘルプを出力します。
-我ら US Letter 用紙サイズ用に用意された Postscript ツリー ファイル。
-psonly
ウィンドウ インターフェイスはなく、PostScript ツリー ファイルを記述するだけです。
-サイズ n
分類群名に使用されるフォント サイズ n。
-pc n PostScript 出力のページ数。
-psize 幅×高さ
WIDTHxHEIGHT で表される PostScript ページのサイズ。
-長さ
ツリー ファイルに表示される場合は、枝の長さを表示します。
-ブート ブートストラップ値がツリー ファイルに表示される場合は、ブートストラップ値を表示します。
-無題
PostScript 出力にはタイトルを含めないでください。
onworks.net サービスを使用してオンラインで njplot を使用する
