これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド seealoe です。
プログラム:
NAME
see also - 指定したプログラムと同様の機能を持つプログラムを検索します
SYNOPSIS
こちらも参照 -サーチ string [-爆発する boolean] -エンボス boolean -大使館 boolean
-ショーエンバシー string [-outfile アウトファイル] [-html トグル] [-グループ boolean]
-結腸 boolean
こちらも参照 -助けて
DESCRIPTION
こちらも参照 EMBOSS(「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」)。 これは「Documentation」コマンド グループの一部です。
OPTIONS
入力
-サーチ string
EMBOSS プログラムの名前を入力してください
NEW
-爆発する boolean
EMBOSS アプリケーションが属するグループには、展開されたグループと展開されていないグループの XNUMX つの形式があります。
爆発した。 展開されたグループ名は、より多くの数があり、多くの場合、曖昧な表現になっています。
爆発していないもの。 展開された名前はグループの定義から形成されます
NAME1:NAME2 のように始まり、その後さまざまな組み合わせに拡張される名前
名前の例: 'NAME1'、'NAME2'、'NAME1 NAME2'、NAME2 NAME1'。 展開されていない名前
単に「NAME1 NAME2」のようなものです。 展開されたグループ名を使用すると、さらに多くのグループ名が見つかります
展開されていない名前を使用する場合よりも、展開された名前の少なくとも一部を共有するプログラム
名前が付けられているため、同様の機能を共有していると報告されるプログラムの数が多くなります。
非展開名を使用することを指定した場合は使用します。デフォルト値: N
高機能
-エンボス boolean
このオプションを使用すると、EMBOSS プログラムのドキュメントが検索されます。 これなら
オプションが false に設定されている場合、EMBASSY プログラムのみが検索されます (
-embassy オプションは true)。 EMBASSY プログラムは厳密には EMBOSS の一部ではありませんが、
同じコード ライブラリを使用し、同じルック アンド フィールを共有しますが、一般的に開発されています。
プログラムが GNU General Public License スキームの範囲外であることを望む人々によるもの
デフォルト値:Y
-大使館 boolean
このオプションを使用すると、EMBASY プログラムのドキュメントが検索されます。 これなら
オプションが false に設定されている場合、EMBOSS プログラムのみが検索されます (
-emboss オプションは true)。 EMBASSY プログラムは厳密には EMBOSS の一部ではありませんが、
同じコード ライブラリであり、同じルック アンド フィールを共有しますが、通常は次の方法で開発されます。
プログラムが GNU General Public License スキームの範囲外であることを望む人々
デフォルト値:Y
-ショーエンバシー string
このオプションを使用すると、この EMBASSY パッケージ プログラムのドキュメントは次のようになります。
検索した。 EMBASSY プログラムは厳密には EMBOSS の一部ではありませんが、同じコードを使用します
これらのライブラリは同じルック アンド フィールを共有しますが、通常は次のような人々によって開発されます。
プログラムが GNU General Public License スキームの範囲外であることを希望します
出力
-outfile アウトファイル
デフォルト値:stdout
HTML
-html トグル
出力をファイルに送信する場合、これにより、テーブルとして表示するためにフォーマットされます
WWWドキュメントで。 デフォルト値:N
-グループ boolean
このオプションを使用すると、グループ名のみがファイルに出力されます。デフォルト
値: N
-結腸 boolean
EMBOSS アプリケーションが属するグループには最大 XNUMX つのレベルがあります。
プライマリ グループ「ALIGNMENT」には、いくつかのサブグループまたは第 XNUMX レベルのグループがあります。例:
コンセンサス、差異、ドットプロット、グローバル、ローカル、複数。 解析するプログラムを支援するため
これらのサブグループの名前を必要とする seeAlso の出力では、コロン ':' が次のようになります。
このオプションが true の場合、グループ名の XNUMX 番目のレベルと XNUMX 番目のレベルの間に配置されます。
デフォルト値:N
onworks.net サービスを使用してオンラインで SeeAloe を使用する
