これは、BiomeNet という名前の Linux アプリで、Linux オンラインで実行できます。最新リリースは、BiomeNet.zip としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用してオンラインで Linux で実行するには、BiomeNet という名前のこのアプリをダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linuxオンラインで実行するBiomeNet
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DESCRIPTION
メタゲノミクスは、代謝機能を割り当てることができる膨大な数の微生物配列を生み出します。 コミュニティレベルの代謝の相違を推測するためにそのようなデータを使用することは、適切な統計的枠組みの欠如によって妨げられています。 ここでは、微生物群集間の代謝ネットワークの異なる有病率を推論するための、BiomeNet(代謝ネットワークのベイズ推定)と呼ばれる新しい階層ベイズモデルについて説明します。 コミュニティレベルの代謝相互作用の構造を推測するために、BiomeNetは混合メンバーシップモデリングフレームワークを酵素存在量情報に適用します。 基本的な考え方は、モデルの混合成分(代謝反応、サブネットワーク、ネットワーク)はすべてのグループ(微生物叢サンプル)で共有されますが、混合比率はグループごとに異なります。 このフレームワークを通じて、モデルはデータ内のネストされた構造をキャプチャできます。 BiomeNetは、複雑な代謝システム(メタボシステム)の混合物として各メタゲノムサンプルをモデル化する点でユニークです。Audience
科学/研究
プログラミング言語
C ++、S / R
これは、https://sourceforge.net/projects/biomenet/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。