これは、オンライン Linux で実行する COGsoft という名前の Linux アプリで、最新リリースは COGsoft.04.19.2012.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
COGsoft という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
オンラインの Linux で実行できる COGsoft
Ad
DESCRIPTION
オルソロガス グループのクラスターを作成するためのソフトウェア (新しい EdgeSearch アルゴリズムを搭載)。 最新の参考文献: Kristensen DM、Kannan L、Coleman MK、Wolf YI、Sorokin A、Koonin EV、Mushegian A. Bioinformatics 2010。オプション
- さまざまな手法の長所と短所の説明: Kristensen DM、Wolf YI、Mushegian AR、Koonin EV。 遺伝子オーソロジー推論のための計算手法。 簡単なバイオインフォーム。 2011 12 月;5(379):91-2011。 Epub 19 XNUMX XNUMX。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- アルゴリズム参照: Kristensen DM、Kannan L、Coleman MK、Wolf YI、Sorokin A、Koonin EV、Mushegian A。ゲノム間対称の最良一致からオルソロガス グループのクラスターを組み立てるための低多項式アルゴリズム。 バイオインフォマティクス。 2010 15 26;12(1481):7-2010。 Epub 2 年 XNUMX 月 XNUMX 日。 http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- オーソログ/COG の優れた/徹底的なレビュー: Koonin EV。 オーソログ、パラログ、進化ゲノミクス。 アンヌ牧師ジュネ。 2005;39:309-38。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- オリジナル COG 論文: Tatusov RL、Koonin EV、Lipman DJ。 タンパク質ファミリーに関するゲノムの視点。 化学。 1997 24 278;5338(631):7-XNUMX。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- COG データベース: Tatusov RL、Galperin MY、Natale DA、Koonin EV。 COG データベース: タンパク質の機能と進化をゲノム規模で解析するためのツール。 核酸研究所2000 年 1 月 28 日;1(33):6-XNUMX。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- クーニンラボWebページサイト： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- 公式 FTP サイト: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (ただし、現時点では Readme はsourceforge ページを指しているだけです)
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C + +
これは、https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
