これはComplexHeatmapというLinuxアプリで、最新リリースは1.99.4sourcecode.tar.gzとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
ComplexHeatmap というアプリを OnWorks で無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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複雑なヒートマップ
DESCRIPTION
ComplexHeatmapは、Zuguang GuらによるR/Bioconductorパッケージで、非常に柔軟で複雑、かつ豊富な注釈が付与されたヒートマップや関連する可視化を作成するために設計されています。複数のヒートマップの配置、注釈の追加、ヒートマップの結合、色やレイアウトのカスタマイズ、他のプロットとの統合が可能です。ゲノミクス／バイオインフォマティクス分野では、発現やメチル化などをサイドバー、注釈、クラスタリングなどを用いて表示するためによく使用されます。
オプション
- ComplexHeatmapは、Zuguang GuらによるR/Bioconductorパッケージで、非常に柔軟で複雑、かつ豊富な注釈が付与されたヒートマップや関連する可視化を作成するために設計されています。複数のヒートマップの配置、注釈の追加、ヒートマップの結合、色やレイアウトのカスタマイズ、他のプロットとの統合が可能です。ゲノミクス／バイオインフォマティクス分野では、発現やメチル化などをサイドバー、注釈、クラスタリングなどを用いて表示するためによく使用されます。
- 高度にカスタマイズ可能なレイアウト: さまざまなヒートマップの組み合わせ、分割の調整、複数のヒートマップのマージの処理、他のプロットとの組み合わせなど。
- 豊富な注釈グラフィックのサポート: 棒グラフ、ボックスプロット、画像、ヒートマップ セル クラスタリングなど。
- パフォーマンスとメモリ管理のための大規模ヒートマップのラスタライズ/最適化
- コンパニオン パッケージ (InteractiveComplexHeatmap) を介して Shiny / インタラクティブ ヒートマップと統合し、インタラクティブ性などを実現します。
- ビネット / 広範なドキュメントと例、Bioconductor ディストリビューションからのサポートにより、インストールとアップデートの管理が容易になります。
プログラミング言語
R
カテゴリー
このアプリケーションは、https://sourceforge.net/projects/complexheatmap.mirror/ からも入手できます。OnWorks でホストされているため、無料のオペレーティングシステムから最も簡単にオンラインで実行できます。
