これは、CUSHAW2:Parallel Gapped Read Alignmentという名前のLinuxアプリであり、最新リリースはcushaw2-v2.1.11.tar.gzとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
CUSHAW2:OnWorksとのParallel Gapped ReadAlignmentという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
CUSHAW2:並列ギャップ読み取りアラインメント
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DESCRIPTION
CUSHAW2は、ヒトゲノムなどの大きなゲノムへの高速で並列のギャップ付きリードアラインメントです。 シミュレートされたデータセットと実際のデータセットをヒトゲノムにアラインメントすることによるパフォーマンス評価は、CUSHAW2がシングルエンドとペアエンドアラインメントの両方のアラインメント品質の点で一貫して最高ランクのアライナーのXNUMXつであり、非常に競争力のある速度を示していることを示しています。 さらに、当社のアライナは、CPUスレッドの数に関して優れた並列スケーラビリティを示しています。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C + +
これは、https://sourceforge.net/projects/cushaw2/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。