これは、オンライン Linux で実行する DeNovoCheck という名前の Linux アプリで、最新リリースは DeNovoCheck_270113.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
DeNovoCheck という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する DeNovoCheck
DESCRIPTION
DeNovoCheck は、NGS tio データの継承分析に使用することを目的としています。 まれな優性メンデル病の場合、候補となる変異の数を減らすために、患者と親のトリオがよく使用されます。 このアルゴリズムは、親 BAM ファイルで利用可能なデータに基づいて継承予測を行い、潜在的な de novo バリアントの迅速かつ信頼性の高い選択を可能にします。オプション
- NGS トリオ データの de novo バリアントを特定する
- コマンドラインパラメータ
- プロパティファイルの構成
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Java
これは、https://sourceforge.net/projects/denovocheck/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
