これは、Linux オンラインで実行する FamSeq という名前の Linux アプリで、最新リリースは FamSeq1.0.2.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
FamSeq という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行する FamSeq
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DESCRIPTION
希少な変異体を呼び出すのは依然として困難です。 家族ベースのシーケンス研究では、新しい生殖系列変異をより正確に特定するために、家族全員からの情報を利用する必要があります。 FamSeq は、家族全員の生の測定値を基に、個人が変異体を保有している確率を提供することでこの目的を果たします。 FamSeq は de novo 突然変異に対応し、染色体 X でバリアントコールを実行できます。データの複雑さの変化に対応するために、FamSeq はメンデル遺伝モデルの XNUMX つの異なる実装 (ベイジアン ネットワーク アルゴリズム、エルストン スチュワート アルゴリズム、マルコフ連鎖モンテカルロ アルゴリズム) で構成されています。 ソフトウェアを効率的にし、大家族に適用できるようにするために、NVIDIA® グラフィックス プロセッシング ユニットでの計算精度を損なうことなく、近親交配ループを持つ血統に対処するベイジアン ネットワーク アルゴリズムを並列化しました。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
C + +
これは、https://sourceforge.net/projects/famseq/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
