これは ForceGen という名前の Linux アプリで、最新リリースは ForceGenV0.4.jar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
ForceGen with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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フォースジェネ
DESCRIPTION
引用してください：ForceGen: Gromacs の原子共有結合定数の導出。 ナッシュ A、コリアー T、バーチ HL、デ レーウ NH。 分子モデリングジャーナル (2018)、(24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
指導ビデオ：
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
この Java 実行可能 jar は、量子力学的ガウス計算から結合伸長と結合角の XNUMX 次結合力定数を導出します。 この計算は、Amber 力場ファミリー、または分子フラグメントのヘッセ行列の XNUMX 次テンソルから導出される任意の力場と互換性があります。 出力は Gromacs トポロジ形式と互換性があります。
使用例には、以下の結合力定数と平衡値の導出が含まれます。
-タンパク質の活性部位に結合した金属
-修飾アミノ酸
-低分子/薬物分子
サンプル ファイルの zip は、[すべてのファイルを参照] リンクをクリックすると見つかります。
アンソニー・ナッシュ博士（オックスフォード）著
トーマス・コリアー博士、ヘレン・バーチ教授、
特徴
- 結合伸長力定数の導出
- 結合角力定数の導出
- Gromacs トポロジとの互換性
これは、https://sourceforge.net/projects/forcegen/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
