これは、Genomic SSR マーカー用の GMATA ソフトウェアという名前の Linux アプリで、最新リリースは GMATAv2.2.jar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して、Genomic SSR マーカー用の GMATA ソフトウェアという名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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ゲノムSSRマーカー用GMATAソフトウェア
DESCRIPTION
ソフトウェア GMATA v21 とは何ですか
Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) は、シンプル シーケンス リピート (SSR) 解析、および任意の DNA 配列における SSR マーカーの設計とマッピングのためのソフトウェアです。 次の機能があります。
1. SSRマイニング;
2. 統計分析とプロット;
3. SSR 軌跡グラフィックの表示。
4. マーカーの設計。
5. 電子マッピングとマーカーの転写性の調査。
GMATA は正確、高感度、高速です。 これは、大規模なゲノム配列データセット、特に大規模な全ゲノム配列を処理するように設計されました。 理論的には、GMATA ではあらゆるサイズのゲノムを簡単に解析できます。 ソフトウェア GMATA はサーバー、デスクトップ、さらにはラップトップでも動作し、クリックするだけでグラフィック インターフェイスで実行したり、コマンド ラインや自動パイプラインで実行したりできます。 また、クロスプラットフォームであり、Unix/Linux、Win、Mac をサポートしています。 ソフトウェア GMATA からの結果は、Gbrowser でゲノムまたは遺伝子の特徴とともに直接グラフィック表示でき、任意のゲノム データベースと簡単に統合できます。
特徴
- あらゆる大規模シーケンスにおける正確かつ最速の SSR マイニング
- 完全な統計分析とプロット
- ゲノム機能を備えた SSR 遺伝子座とマーカー グラフィックを Gbrowser に表示
- 特異的SSRマーカーの設計と模擬PCR
- 電子マッピング、マーカー転写性調査
- でも利用可能 https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
これは https://sourceforge.net/projects/gmata/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
