これはKinannoteという名前のLinuxアプリで、最新リリースはKinannote_1.0.tarとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Kinannoteという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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キナンノート
DESCRIPTION
Kinannoteは、セリン/スレオニンプロテインキナーゼに由来するHMM、HMMに由来する位置特異的スコア行列を使用して、ユーザー提供のfastaファイル内のプロテインキナーゼを識別および分類し、 キナーゼ.com。 ユーザーが完全なプロテオームを入力すると、追加のモジュールがキノームの完全性を評価し、参照キノームとの関連で配置します。 KinannoteはUNIXコマンドラインで実行され、ローカルのhmmer2およびBlast2.24のインストールに依存します。
キナンノートの引用:
真核生物のプロテインキナーゼスーパーファミリーのメンバーを特定および分類するためのコンピュータープログラム、Kinannote
ジョナサンM.ゴールドバーグ; アリソングリッグス; ジャネットL.スミス; ブライアンハース; ジェニファーワートマン; Qiandong Zeng
バイオインフォマティクス2013; 土井:10.1093 / bioinformatics / btt419
http: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
pdf: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/kinannote/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。