これは、最新リリースをLocusVu.tar.gzとしてダウンロードできるLinuxオンラインで実行するlocusvuという名前のLinuxアプリです。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
このアプリlocusvuをダウンロードしてオンラインで実行し、OnWorksを使用してLinuxでオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linuxオンラインで実行するlocusvu
DESCRIPTION
LocusVuは、ゲノム遺伝子座（染色体上の位置）のリストを入力として受け取り、UCSCゲノムブラウザーなどの公開データベースからの関連情報（細胞遺伝学的バンド、遺伝子名、OMIMデータなど）のフェッチを自動化する新しいJavaベースのソフトウェアツールです。データベース。 次に、取得した結果に対して複数のワークフローを有効にします。たとえば、複数のデータセット（比較ゲノミクス）を比較したり、ツール自体から遺伝子座の隣接遺伝子を表示したり、これらの結果を棒グラフや円グラフでグラフィカルに表現したりできます。 LocusVuのフロントエンドにはシンプルで使いやすいGUIがあり、基盤となるロジックとの直感的なユーザー操作が可能です。このツールは、他のデータベース（Ensemblなど）のサポートを追加したり、情報を取得したりするために簡単に拡張できます。
データベース内の他のテーブルから。 したがって、LocusVuは、ゲノミクスでのデータ分析をサポートするために、既存のワークフローを簡素化し、新しいワークフローを作成する際に、ユーザーと開発者が同様に使用できる基本的なフレームワークを提供します。
特徴
- データベース（現在はUCSCゲノムブラウザーデータベース）からのデータ取得を自動化します
- 次のような取得結果のワークフローを有効にします。
- ..複数のデータセットの比較（比較ゲノミクス）
- ..遺伝子座の隣接遺伝子を表示する（ツール自体の中から）
- ..結果をグラフィカルに表す（棒グラフ/円グラフ）
- 直感的に使用できるフロントエンドの使いやすいGUI
- 簡単なデバッグのためのLog4jによるロギング
- 簡単に拡張可能
Audience
科学/研究、開発者
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java
データベース環境
MySQL
これは、https：//sourceforge.net/projects/locusvu/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
