これは MaxBin という名前の Linux アプリで、最新リリースは MaxBin-2.2.7.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
MaxBin with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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マックスビン
DESCRIPTION
MaxBinは、期待値最大化アルゴリズムに基づいて、組み立てられたメタゲノムシーケンスをビニングするためのソフトウェアです。 ユーザーは、組み立てられたメタゲノムシーケンスとリードカバレッジ情報またはシーケンスリードを提供するだけで、メタゲノム内の微生物の基礎となるビン(ゲノム)を理解できます。 ユーザーの便宜のために、MaxBinは、推定された完全性、GC含量、ゲノムサイズなどのゲノム関連の統計をビニングの概要ページに報告します。 ユーザーは、MaxBinビンでMEGANまたは同様のソフトウェアを使用して、ビニングプロセスが終了した後、各ビンの分類法を見つけることができます。
最新バージョンは2.2.7です。
MaxBinがMicrobiomeジャーナルに掲載されました(2:26)! 仕事でMaxBinを使用する場合は、Microbiomeの論文を引用してください。
特徴
- メタゲノミクスビニング
Audience
ヘルスケア産業
プログラミング言語
Perl、C ++
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/maxbin/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。