これは MaxBin2 という名前の Linux アプリで、最新リリースは MaxBin-2.2.7.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
MaxBin2 with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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MaxBin2
DESCRIPTION
MaxBin2 は、次世代の MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) 複数のサンプルを同時にサポートします。 MaxBin は、期待値最大化アルゴリズムに基づいて組み立てられたメタゲノム配列をビニングするためのソフトウェアです。 ユーザーは、組み立てられたメタゲノム配列とリードカバレッジ情報またはシーケンスリードを提供するだけで、メタゲノム内の微生物の基礎となるビン(ゲノム)を理解できます。 ユーザーの利便性を考慮して、MaxBin は推定完全性、GC コンテンツ、ゲノム サイズなどのゲノム関連統計をビニング概要ページにレポートします。 ユーザーは、MaxBin ビンに対して MEGAN または同様のソフトウェアを使用して、ビン分割プロセスの終了後に各ビンの分類を確認できます。詳細については、MaxBinの公式Webサイトを参照してください。 http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
オプション
- メタゲノミクスビニング
プログラミング言語
C + +
これは https://sourceforge.net/projects/maxbin2/ から取得することもできるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。