これは、Linux オンラインで実行する mCarts という名前の Linux アプリで、最新リリースは mCarts.v1.2.0.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
mCarts という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
オンラインの Linux で実行する mCarts
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DESCRIPTION
多くの RBP は非常に短く縮重した配列を認識し、複数のクラスター化部位への相乗的結合や、異なる RNA 二次構造を介した部位へのアクセス可能性の調節などのメカニズムによってターゲティング特異性が達成されます。 mCarts は、個々のモチーフ部位の数と間隔、それらのアクセス可能性と保存性を統合し、シグナル対ノイズ比を大幅に改善します。 このアルゴリズムは、架橋および免疫沈降によって単離された RNA のハイスループットシークエンシング (HITS-CLIP) から得られる多数の in vivo RBP 結合部位を利用して、これらの特徴の規則を学習および定量化します。 このアルゴリズムを適用して、XNUMX つの代表的な RBP、Nova と Mbnl を研究しました。 個々のモチーフ要素の情報量が非常に少ないにもかかわらず、私たちのアルゴリズムは実験的検証を成功させるための非常に具体的な予測を行いました。Audience
科学/研究、上級エンドユーザー
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
パール
これは、https://sourceforge.net/projects/mcarts/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
