これは、metasort という名前の Linux アプリで、最新リリースは metaSort.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Metasort with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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メタソート
DESCRIPTION
最新のアプローチでは、参照ゲノムを利用してメタゲノム データを分析します。 しかし、新規微生物群集は参照データベースの範囲をはるかに超えており、複雑な微生物群集からの新規メタゲノム構築は依然として大きな課題となっています。 今回我々は、メタゲノムサンプルから細菌ゲノムを効果的に構築するための、新しい実験的かつバイオインフォマティックなフレームワークであるメタソートを紹介します。 MetaSort は、フローサイトメトリーおよび単一細胞シークエンシング手法に基づいてソートされたミニメタゲノムのアプローチを提供し、新しい計算アルゴリズムを採用して、元のメタゲノムの相補性によってソートされたミニメタゲノムから高品質のゲノムを効率的に回収します。 シミュレートされたデータセット、唾液、腸内マイクロバイオームに関する広範な評価を通じて、メタソートがゲノムの回収と構築において優れた公平なパフォーマンスを発揮することを実証しました。
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/metasort/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
