これは、misc genomics tools という名前の Linux アプリで、最新リリースは misc_genomics_tools_v0.2.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Misc genomics tools with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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その他のゲノミクスツール
DESCRIPTION
これは、シュードモナス株 NCIMB10586 を含む、ゲノミクス プロジェクトの過程で開発されたさまざまなプログラムのコレクションです。
これらには、
* イルミナリードを使用した（例）pacbio ゲノム配列のエラーの特定と修正
* 原核生物の配列/ゲノムのアノテーション
* RNAseq 分析 - 複数のサンプルをグループとして正規化および照合します。
* RNAseq の可視化
すべてのスクリプトは「ベストエフォート」ベースで提供されていますが、さまざまなシステム変更のため、すべてのファイルが分析に使用されたバージョンであることは保証されません。
また、これらは便宜を念頭に置いて開発されたものであることにも注意してください。つまり、プロセスは最終的な形式で一度実行されることが期待されていました。 ランタイムの最適化やスクリプトの連鎖にはほとんど注意が払われず、場合によっては外部リソースに手動でアクセスすることがあります。
オプション
- ゲノム配列エラーの修正
- 原核生物配列のアノテーション
- グループとしての複数のサンプルの RNAseq 正規化
- RNAseqサンプルシリーズ/時間経過の可視化
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
