これは、Molecular Dynamics Studioという名前のLinuxアプリであり、最新リリースはWindowsRelease.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksを使用したMolecularDynamicsStudioという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
Ad
分子動力学スタジオ
DESCRIPTION
これは、分子動力学セルを簡単に作成する目的で、NanoEngineer-1、PACKMOL、およびMSI2LMPを統合するために作成されたソフトウェア変更のコレクションです。 NanoEngineer-1は、Nanorexによって作成された分子CADソフトウェアであり、ユーザーが分子を作成する簡単な方法を提供します。ソフトウェアの変更により、ユーザーは複数の力場を使用して原子を入力できます。 PACKMOLは、NanoEngineer-1の分子テンプレートを使用して分子のランダムなコレクションを生成できるため、最初のMDセルを提供します。 PACKMOLを変更すると、原子タイプのデータをMSI2LMPソフトウェアに渡すことができます。 MSI2LMPは、クラスIまたはクラスIIの力場に基づいてLAMMPS入力ファイルを作成します。 MSI2LMPは、NanoEngineer-1によって生成された数値コード化された力場データを使用するように変更されました。 MMPファイル形式が拡張され、XNUMXつのソフトウェアアプリケーションすべてに統合されました。
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
特徴
- NanoEngineer-1による分子CAD機能
- CFF91原子力場に基づいて原子を手動で入力します
- NanoEngineer-1を使用して分子テンプレートを作成する
- PACKMOLと複数の分子テンプレートを使用してMDセルを生成します
- MSI2LMPを使用してLAMMPSジオメトリ入力ファイルを生成する
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
OpenGL、Qt
プログラミング言語
Fortran、Python、C ++、C
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/moleculedynami/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
