This is the Linux app named Molly.jl whose latest release can be downloaded as v0.22.3sourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Download and run online this app named Molly.jl with OnWorks for free.
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
Ad
モリー.jl
DESCRIPTION
Much of science can be explained by the movement and interaction of molecules. Molecular dynamics (MD) is a computational technique used to explore these phenomena, from noble gases to biological macromolecules. Molly.jl is a pure Julia package for MD, and for the simulation of physical systems more broadly. The package is described in a talk at Enzyme Conference 2023 and an earlier talk at the JuliaMolSim minisymposium at JuliaCon 2022. Slides are also available for a tutorial in September 2023.
オプション
- Non-bonded interactions
- Bonded interactions
- Interface to allow definition of new interactions, simulators, thermostats, neighbor finders, loggers etc.
- Verlet, velocity Verlet, Störmer-Verlet, flexible Langevin and Nosé-Hoover integrators
- Andersen, Berendsen and velocity rescaling thermostats
- Periodic, triclinic and infinite boundary conditions
- Flexible loggers to track arbitrary properties throughout simulations
プログラミング言語
ジュリア
カテゴリー
This is an application that can also be fetched from https://sourceforge.net/projects/molly-jl.mirror/. It has been hosted in OnWorks in order to be run online in an easiest way from one of our free Operative Systems.
