これは、Natural 製品類似度計算機という名前の Linux アプリで、最新リリースは Natural_Product_Likeness_calculator_2.1.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorksを使用したNaturalproduct likenesscalculatorという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
天然物類似計算機
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DESCRIPTION
分子の天然物（NP）の類似性、つまり、既知の天然物がカバーする構造空間に対する分子の類似性を計算します。 NPらしさは、化合物ライブラリをスクリーニングし、新しいリード化合物を設計するための有用な基準です。
Mavenの依存関係：
uk.ac.ebi.cheminformatics
NP-Likeness
2.1
必要なリポジトリ：
エビレポ
EBIMavenリポジトリ
http://www.ebi.ac.uk/~maven/m2repo
NS
プロジェクトの最新バージョンは、GITリポジトリで入手できます。 https://github.com/CS76/NP-Likeness
特徴
- データセット内の冗長構造を確認します
- 分子の標準化（対イオンと金属の除去）
- 線形およびリングシュガーを削除します
- アトムシグネチャを生成する
- 天然物の利用可能なオープンデータに基づいて、特定の分子の天然物の類似性を計算します
- I / O用のSDFとSMILES
- 独自の社内トレーニングセットを使用してスコアを計算します
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/np-likeness/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
