これは NeedlemanWunsch という名前の Linux アプリで、最新リリースは needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
NeedlemanWunsch という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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ニードルマンワンシュ
DESCRIPTION
GITHUBに移動： https://github.com/noporpoise/seq-align
Needleman-Wunsch アルゴリズムを使用したグローバル最適配列アラインメント。
DNA、RNA、タンパク質配列などを整列させます。
Smith-Waterman を使用した姉妹プロジェクトのローカル アライメントを参照してください。
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
特徴
- アフィンギャップペナルティ
- アライメントの開始時と終了時のギャップに対してギャップ ペナルティを設定できません
- 着色された出力
- FASTA、FASTQ、およびプレーンシーケンスファイル（gzipで圧縮されたファイルを含む）を読み取ります
- プリセットDNA /タンパク質置換マトリックス（PAM / BLOSUMなど）
- 置換ペナルティ行列をロードできます
- 他のバイオインフォマティクスプロジェクトで使用できるポータブルCコード
Audience
科学/研究、教育
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル、コマンドライン
プログラミング言語
C ++、C
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
