これは PB-sQF_BacterialTyping という名前の Linux アプリで、最新リリースは PBsQF_Mac.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PB-sQF_BacterialTyping という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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PB-sQF_BacterialTyping
DESCRIPTION
確率ビニング - シグネチャー Quadratic Form、PB-sQF は、628 の細菌ライブラリー ゲノムの XNUMX つに未知の配列を入力し、最小の検定統計量を与えるため、最も類似したライブラリー株を提供します。
入力ファイルは、未知の組み立てられたゲノム配列の k-mer カウント、または P. Audano らが開発した KAnalyze によって生成された XNUMX 進形式の生のショート リード ファイルです。 (https://sourceforge.net/projects/kanalyze/).
ダウンロードには、ライブラリ インデックス、ライブラリ名、および未知のサンプルが含まれていました。
オプション
- ライブラリーと未知の k-mer 頻度の間の検査統計の計算
- 細菌の配列タイピング
- Windows
- Mac
プログラミング言語
マトラブ
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/pb-sqf-bacteriatyping/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
