これは PSOVina 2.0 という名前の Linux アプリで、最新リリースは POSE_PREDICTION.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PSOVina 2.0 with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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PSOビナ2.0
DESCRIPTION
Particle Swarm Intelligence の効率的な最適化アルゴリズムと AutoDock Vina のフレームワークに基づく高速ドッキング ツール。 初期の PSO 実装に基づいて、当社の PSOVina メソッドはドッキング精度を強化し、元の AutoDock Vina と比較して顕著な効率を達成するためにいくつかの重要な改良を受けています。特徴
- AutoDock Vina よりもはるかに高速で、精度が向上または同等
- タンパク質とリガンドのドッキングや仮想スクリーニングに最適
- 最新バージョン PSOVina-2.0 は、グローバル検索にシンガー カオス関数を組み込み、ローカル検索に効率的な 2 段階メソッドを組み込みます。
- Vina よりも 6 ～ 7 倍の高速化を達成
これは、https://sourceforge.net/projects/psovina/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
