これは PyPedal という名前の Linux アプリで、最新リリースは PyPedal-2.0.3.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PyPedal with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Pyペダル
DESCRIPTION
PyPedalは、血統の操作、血統の簡単な視覚化、および血統からの遺伝的多様性の測定値の計算のためのツールを提供するPythonモジュールです。
オプション
- ユーザー定義形式での家系図ファイルの読み取り
- 家系図の整合性のチェック (ID の重複、親が子より若いなど)
- 家系図ファイル内の出現頻度などの概要情報の生成
- 家系図ファイルの並べ替えと番号付け
- 表形式法を使用した家系図ファイルからの分子関係行列 (A) の計算
- 大規模な血統の近親交配の計算
- 近親交配と関係の平均合計係数と平均個別係数の計算
- 反復表法を使用した部分近親交配の係数の計算 (Lacy, 1996; Gulisija, 2006)
- Ballou (1997) または Suwanlee et al. の方法を使用した祖先近親交配の係数の計算。 (2007)
- 理論的および実際の有効人口規模の計算
- Lacy の正確なアルゴリズムを使用した有効創設者数の計算
- Boichard et al.の近似アルゴリズムを使用した有効創設者数の計算。
- Boichard et al.のアルゴリズムを使用した有効祖先数の計算。
- 動物のすべての祖先を含む下位系統の選択
- XNUMX 匹の動物の共通の親戚の特定
- 将来の交配による子孫の近親交配の計算
- 行列、近親交配と関係の係数、概要情報を含む ASCII テキスト ファイルへの出力
- GEDCOM 5.5 ファイルのインポートとエクスポート
- GENES 1.20 (dBase III) ファイルのインポートとエクスポート
- MySQL、Postgres、SQLite データベースからの系統の読み込みと保存
- Matvec 1.1a のアルゴリズムから派生したアルゴリズムを使用した家系図のシミュレーション
Audience
教育、科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Python
データベース環境
MySQL、PostgreSQL（pgsql）、SQLite
カテゴリー
これは https://sourceforge.net/projects/pypedal/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
