これはQSdpRという名前のLinuxアプリで、最新リリースはrun1.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksでQSdpRという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
QSdpR
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DESCRIPTION
これは、mRNAウイルスの準種アセンブリ問題のためのウイルス準種再構築ソフトウェアであり、相関クラスタリングアプローチに基づいており、半正定値最適化フレームワークを使用しています。 このソフトウェアは、リファレンスゲノム、このリファレンスにアラインされたNGSリードセット、およびvcfファイルの形式のSNP位置のセットを受け入れ、基礎となるウイルス集団を説明する再構築された種ゲノムの最適なセットを出力します。
オプション
- 準種
- mRNAウイルス
- クラスタリング
- 半正定値計画
- HIV-1ウイルス
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Unixシェル、Python、C
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/qsdpr/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
