これは QUASR という名前の Linux アプリで、最新リリースは QUASR_v6.08.tar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorks を使用して QUASR という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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クワスル
DESCRIPTION
QUASR は、Illumina、454、および Ion Torrent プラットフォームからの次世代シーケンス (NGS) データを処理および分析するために作成された軽量パイプラインです。 元々はウイルス データ用に作成されましたが、あらゆる NGS データセットで動作するのに十分な汎用性があります。 機能には次のものが含まれます。
重複の削除
逆多重化
プライマー除去
品質保証 (QA) グラフ作成
コンセンサス生成
少数派バリアントの決定
少数派バリアントのグラフ作成
現在の主なバージョンは 6.X で、Python3 で書かれています。 7.X は Java で書き直したものですが、まだ作業中です。 どちらも可能な限り軽量になるように記述されているため、デスクトップやラップトップ、さらにはコンピューティング クラスター上でも最小限のメモリ要件で実行できます。
QUASR に関して問題がある場合は、README に記載されている電子メール アドレスまでご連絡ください。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/quasr/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。