これは RNA@ という名前の Linux アプリで、最新リリースは RNAAT-V1.1.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
RNA @という名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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RNA @
DESCRIPTION
RNA @は、軽量化されたAho-Corasickのようなアルゴリズムに基づく原核生物用のRNAアノテーションツールです。 アルゴリズムの原理は、ヌクレオチド配列のデータセットを有限状態マシンにエンコードして、ゲノムの300,000回の読み取りでゲノム内のすべてのヌクレオチド配列のすべての出現を認識できるようにすることです。 ヌクレオチド配列データセットとして、RNA @はNCBIに寄託された約25,000のRNAのコレクションを使用します。 これらのRNAは、約XNUMXの完全に寄託されたゲノムから自動的に収集されます。
あなたはで見つけるでしょう https://drive.google.com/file/d/1lEj5SSHpQSv54nOroxBcS_jvLFRIKNmm/view?usp=sharing" アーキアとバクテリアの30,558ゲノム（06年2021月XNUMX日のNCBI日に寄託されたゲノムの中で「完全ゲノム」または「染色体」とマークされたすべてのアーキアとバクテリアのゲノム）についてRNA @によって再注釈が付けられたRNA。
データベースの最新バージョンは、次のURLからダウンロードすることもできます。 http://rnaat.ufpa.br
これは、https：//sourceforge.net/projects/rnaat/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
