これはLinuxでオンラインで実行できるSOAPsvというLinuxアプリです。最新リリースはAsmSV.zipとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
SOAPsv というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux で無料でオンラインで実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行できる SOAPsv
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DESCRIPTION
これは、信頼性の高いホモ接合構造変異の同定のための以前の方法を補完するアプローチです。 当社のアプローチは、Illumina Genome Analyzer シーケンスデータの de novo アセンブリに基づいて、参照ゲノムと比較して遺伝子型とブレークポイントを正確に決定します。 ヘテロ接合構造変異の検出にはハプロタイプ配列のアセンブリが必要ですが、既存のアセンブラーではまだ不可能であるため、この方法ではホモ接合構造変異のみを検査しました。ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
AWK、C++、Perl、Unix シェル
これは、https://sourceforge.net/projects/soapsv/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
