これは SplitMEM という名前の Linux アプリで、最新リリースは splitmem.1.0.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
SplitMEM with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スプリットMEM
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DESCRIPTION
改良されたシーケンシング技術の台頭により、ゲノミクスは種ごとの単一の参照パラダイムから、複数の個人が一緒に表現および分析されるより包括的なパンゲノムアプローチに拡大しています。 ここでは、splitMEMと呼ばれる新しいO（n log n）時間および空間アルゴリズムを紹介します。これは、全長nのパンゲノムの圧縮されたdeBruijnグラフを直接構築します。 この時間計算量を実現するために、接尾辞スキップで接尾辞ツリーを拡張します。これは、複数の接尾辞リンクを一定時間でトラバースできる新しい構成であり、接尾辞ツリーのトラバーサル中にそれらを使用して最大完全一致（MEM）を効率的に分解します。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C + +
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/splitmem/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
