これは、オンライン Linux で実行する StatAlign という名前の Linux アプリで、最新リリースは StatAlign-v2.1.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
StatAlign という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行する StatAlign
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DESCRIPTION
StatAlignは、タンパク質、DNA、RNA配列のベイズ分析用の拡張可能なソフトウェアパッケージです。 マルチプルアラインメント、系統樹、および進化パラメータは、マルコフ連鎖モンテカルロフレームワークで共推定され、結果の精度の信頼性の高い測定を可能にします。このアプローチは、計算時間が長くなるという犠牲を払って、従来の方法が苦しむ一般的なアーティファクトを排除します。 これらのアーティファクトには、構築された系統発生の単一の（おそらく最適ではない）アラインメントへの依存性と、アラインメントが依存するガイドツリーへのバイアスが含まれます。
分析の背後にあるモデルにより、進化的に離れた配列の比較が可能になります。TKF92の挿入-削除モデルは、任意の置換モデルに結合できます。 パッケージにはヌクレオチドおよびアミノ酸データの幅広いモデルが含まれており、プラグイン管理システムにより、新しいモデルを簡単に追加できます。
これは、https：//sourceforge.net/projects/statalign/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
