これは、SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster to run in Linux online という名前の Linux アプリで、その最新リリースは swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
SWAPHI-LS という名前のこのアプリをダウンロードしてオンラインで実行します。Xeon Phi Cluster でのアライメントは、OnWorks を使用してオンラインで Linux で無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
SWAPHI-LS: Linux オンラインで実行するための Xeon Phi Cluster の調整
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DESCRIPTION
Intel Xeon Phi クラスターを利用して長い DNA 配列のアラインメントを加速する最初の並列 Smith-Waterman アルゴリズム。 このアルゴリズムは、C++ (一連の SIMD 組み込み拡張機能を使用)、OpenMP、および MPI で記述されています。 パフォーマンス評価では、アルゴリズムが非常に安定したパフォーマンスを達成し、単一の Xeon Phi で最大 30.1 GCUPS、ホストを共有する 111.4 つの Xeon Phi で最大 XNUMX GCUPS のパフォーマンスを実現することが明らかになりました。Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル、コマンドライン
プログラミング言語
C + +
これは https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/ からも取得できるアプリケーションです。 これは、OnWorks でホストされており、無料のオペレーティング システムの XNUMX つからオンラインで簡単に実行できます。
