これは、Intel Xeon Phi 上の SWAPHI: Smith-Waterman という名前の Linux アプリで、最新リリースは swaphi-v1.0.5.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
SWAPHI: Smith-Waterman という名前のこのアプリを、OnWorks を搭載したインテル Xeon Phi 上で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
SWAPHI: インテル Xeon Phi に関するスミス-ウォーターマン
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DESCRIPTION
共有ホストの複数のインテル Xeon Phi コプロセッサー上での Smith-Waterman タンパク質データベース検索を高速化する初の並列アルゴリズム。 UniProtKB/TrEMBL データベースに対して検索することで、SWAPHI は 58.8 台の Xeon Phi で最大 228.4 億セル更新/秒 (GCUPS)、XNUMX 台の Xeon Phi で最大 XNUMX GCUPS のパフォーマンスを実現します。
Audience
科学/研究、教育、工学
ユーザーインターフェース
.NET / Mono、コンソール/ターミナル
プログラミング言語
C++、アルゴリズム 68
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/swaphi/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。