これは、オンライン Linux で実行する VIGOR3 という名前の Linux アプリで、最新リリースは VIGOR3.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
VIGOR3 という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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VIGOR3 をオンライン Linux で実行
DESCRIPTION
VIGOR は、ウイルスゲノム内のコーディング遺伝子に注釈を付けるためのツールです。 これは、JCVI 感染症ゲノム配列決定センター (GSCID) の Jeffrey Hoover と Shiliang Wang によって開発されました。http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
連絡先：
ジェフ・フーバー
301-540-7858
[メール保護]
オプション
- RNA 編集、リボソーム スリッページ、終止コドン リードスルー、代替開始コドンを理解します。
- ポリタンパク質上の成熟ペプチドに注釈を付けます
- スプライス、重複、埋め込まれた遺伝子を処理します
- 環状ゲノム、部分ゲノム、およびドラフト (ギャップのある) ゲノムを処理します
- アセンブリ内のフレームシフトを診断します
- 50 種以上の参照データセットが含まれています
- 新しい参照データセットを作成するためのツールが含まれています
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
パール
データベース環境
SQLiteの
これは https://sourceforge.net/projects/vigor3/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
