これは BLAST Ring Image Generator という名前の Windows アプリで、最新リリースは BRIG-0.95-dist.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
OnWorksを使用したBLASTRing ImageGeneratorという名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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BLASTリングイメージジェネレーター
DESCRIPTION
BRIGはクロスプラットフォーム（Windows / Mac / Unix）アプリケーションであり、ゲノムアセンブリデータの処理に重点を置いて、多数のゲノム間の循環比較を表示できます。BRIGを使用して出版物の図を生成する場合は、BRIGの論文を引用してください：NF Alikhan、NK Petty、NL Ben Zakour、SA Beatson（2011）BLAST Ring Image Generator（BRIG）：単純な原核生物ゲノム比較、BMC Genomics、12：402。 PMID：21824423
特徴
- 画像は、中央の参照シーケンスと同心リングとしての他のシーケンスとの類似性を示しています。
- BRIGは、すべてのBLAST比較とファイル解析をシンプルなGUIを介して自動的に実行します。
- ドラフトゲノムのコンティグ境界と読み取りカバレッジを表示できます。 カスタマイズされたグラフと注釈を表示できます。
- ユーザー定義の遺伝子セットを入力として使用することで、BRIGは、完全なゲノム、ドラフトゲノム、さらには未加工のアセンブルされていないシーケンスデータのセットで、遺伝子の存在、不在、切り捨て、またはシーケンスの変化を表示できます。
- BRIGは、SAM形式のリードマッピングファイルも受け入れ、複数のサンプルからのアセンブルされていないシーケンスデータに存在するゲノム領域を同時に比較できるようにします
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/brig/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
