これは ShuffleFastaSeq という名前の Windows アプリで、最新リリースは ShuffleFastaSeq.exe としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
ShuffleFastaSeq という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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シャッフルファスタシーケンス
DESCRIPTION
ShuffleFastaSeq は、FASTA 形式のシーケンスをシャッフルするための、C# で書かれた Windows フォーム アプリケーションです。 ランダムな置換は、Durstenfeld によって実装された Fisher-Yates アルゴリズムの単純なバリエーションを使用して取得されます (https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) (Knuth DE、コンピューター プログラミングの技術: 半数値アルゴリズム、第 3 版、ボストン: Addison-Wesley、1997)。 入力ファイルには、FASTA 形式のシーケンスが 100 つ以上含まれています。 各シーケンスのシャッフル数 (n) を設定できます。 デフォルトの n は XNUMX です。出力ファイルには、入力シーケンスごとに FASTA 形式でシャッフルされたコピーが n 個含まれています。
たとえば (n=3):
入力ファイル：
>a
ACGGT
>b
GCCCATTC
出力ファイル：
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
Win32（MS Windows）
プログラミング言語
C#
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
