これは VariantMaster という名前の Windows アプリで、その最新リリースは variantMaster-1.02.tar.gz としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
VariantMaster with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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バリアントマスター
DESCRIPTION
単一遺伝子疾患の正確な診断のためのハイスループットシーケンシングデータの利用に対する臨床遺伝学への関心が急速に高まっています。 HTS からのバリアントの識別を改善するために、家族性および散発性の遺伝性疾患の原因となるバリアントを正確かつ効率的に抽出する独自のプログラムである VariantMaster を開発しました。 このアルゴリズムは、罹患した個人または腫瘍サンプルの予測バリアント (SNP およびインデル) を考慮し、行 (BAM) データを利用して、家族内の分離の条件付き確率、およびそれが de novo または体細胞である確率を確実に推定します。 . 家族性のケースでは、X連鎖、常染色体優性、および劣性(ホモ接合性または複合ヘテロ接合性)のさまざまな遺伝様式が考慮されます。 さらに、VariantMaster は表現型と遺伝子型を統合し、Annova を使用して、一般集団の対立遺伝子頻度および損傷スコアとして追加情報を生成します。これは https://sourceforge.net/projects/variantmaster/ からも取得できるアプリケーションです。 これは、OnWorks でホストされており、無料のオペレーティング システムの XNUMX つからオンラインで簡単に実行できます。

