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YeastpProfileはLinux上でWindowsでオンラインで実行できます

YeastpProfile を無料でダウンロードして、Linux のオンライン Windows アプリで実行し、Ubuntu、Fedora、または Debian で Wine をオンラインで実行します

これは、Linux経由でWindows上でオンラインで実行できるYeastpRofileというWindowsアプリケーションです。最新リリースはYeastpRofile_V.2.zipとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。

YeastpRofile というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux 経由で Windows で無料で実行できます。

このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。

-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。

--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。

-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。

-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。

-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。

-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。

-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。

WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。

スクリーンショットは

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YeastpProfile は Linux オンラインで Windows オンラインで実行できます


DESCRIPTION

YeastpRofile は、C# で記述されたポータブル Windows フォーム アプリケーションで、酵母 mRNA の転写開始 (TSS) および転写終結 (TTS) 部位周辺のゲノム変数のプロファイルを計算します。プロファイルは、転写された鎖の増分シフトにおけるゲノム変数値と TSS (または TTS) カウント間のゲノム全体のピアソン相関係数 (R) を計算することで得られます。プロファイルを計算するために使用した TSS および TTS カウントのデータは、Pelechano ら (1) の研究から取得されました。入力ファイルは、酵母ゲノム シーケンス リリース R64 に基づく BedGraph 形式のファイルである必要があります。出力ファイルは、TSS または TTS に関する変数座標のさまざまなシフトの R 値を報告するタブ区切りのテキスト テーブルです。XNUMX つの転写方向で同様のプロファイルが得られることを確認するために、各鎖に関連する R も報告されます。
1) V. Pelechano、W. Wei、LM Steinmetz、「アイソフォームプロファイリングによって明らかになった広範な転写異質性」、Nature、497 (2013) 127-13。

Audience

科学/研究



プログラミング言語

C#



このアプリケーションは、https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/ からも入手できます。OnWorks でホストされているため、無料のオペレーティングシステムから最も簡単にオンラインで実行できます。


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