이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 bp_chaos_plotp 명령입니다.
프로그램:
이름
bp_chaos_plot - DNA 및 RNA 서열의 카오스 플롯
개요
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--형식=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=그래픽 형식
-w/--너비=WIGHT -h/--높이=높이
기술
이 스크립트는 GD 이미지 라이브러리를 사용하여 뉴클레오티드를 시각화하는 이미지 파일을 생성합니다.
카오스 플롯을 사용한 시퀀스.
옵션
유효한 그래픽 형식은 현재 gd, gd2, png, wbmp, jpeg 및 gif입니다.
이미지 파일의 기본 크기는 600x400입니다.
시퀀스 입력은 다음 세 가지 방법 중 하나를 사용하여 제공될 수 있습니다.
이름 없는 인수
bp_chaos_plot 파일명
명명된 인수
bp_chaos_plot -i 파일 이름
표준 입력
bp_chaos_plot < 파일명
피드백
메일 링 기울기
사용자 피드백은 이 모듈과 다른 Bioperl 모듈의 진화에서 필수적인 부분입니다. 보내다
귀하의 의견과 제안은 가급적 Bioperl 메일링 리스트로 보내주십시오. 귀하의 참여
대단히 감사합니다.
[이메일 보호] - 일반 토론
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - 메일링 리스트에 대해
통계 보고서 버그
Bioperl 버그 추적 시스템에 버그를 보고하여 버그와 버그를 추적하는 데 도움이 됩니다.
해결. 버그 보고서는 웹을 통해 제출할 수 있습니다.
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
저자 - 제이슨 스타이치
이메일 [이메일 보호]
연혁
이 코드는 Ian Longden이 작성한혼돈.c용 EMBOSS C 코드를 기반으로 합니다. 포함되는 것은 다음과 같습니다
EMBOSS 코드의 문서:
카오스는 카오스 플롯을 생성합니다. 원래 응용 프로그램은 ACEDB 게놈의 일부입니다.
** Richard Durbin(MRC LMB, 영국)이 작성한 데이터베이스 패키지 [이메일 보호]및
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, 프랑스) [이메일 보호]
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 bp_chaos_plotp 사용
