Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 cassiopee 명령입니다.
프로그램:
이름
cassiopee - Cassiopee 버전 1.0 매뉴얼 페이지
개요
카시오피 [옵션]
기술
용법:
-l: 최대 인덱스 깊이 / 최대 패턴 크기
-u: 나중에 사용할 수 있도록 인덱스 저장
-s: 인덱스할 시퀀스
-p: 검색할 패턴
-f: 검색할 패턴이 포함된 파일
-o: 결과물 파일
-r: 트리 축소 적용
-m: 검색 모드: 0=DNA, 1=RNA, 2=단백질
-a: 알파벳 모호성 검색 허용
-n: 검색에서 최대 연속 N 허용 일치 항목
-e: 검색에서 최대 대체 허용 일치 항목
-i: 검색에서 최대 indel 허용 일치 항목
-g: 그래프의 도트 파일 생성
-d: 그래프의 최대 깊이
-t: 출력 형식: 0:tsv(기본값), 1:json
-x: 시퀀스의 최소 위치
-y: 시퀀스의 최대 위치
-v: 버전 표시
-h: 이 메시지 표시
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 카시오피 사용
